Küresel çaptaki bir salgın, yeryüzündeki bütük erkek memelileri öldürdükten yaklaşık 4 yıl sonra, olayın iki istisnası Yorick Brown ve maymunu Ampersand kendilerini Japonya'da bulurlar. Ampersand'i kaçıran eli kılıçlı bir paralı askeri takip eden Yorick ve yoldaşları (hükümet ajanı 355 ve biyokimyager Dr Allison Mann) onu, erkeklerin kaybını kültürlerinde Japon tarzında kabul eden Yükselen Güneş ülkesine kadar takip etmişlerdir.
Bedeni insanlığın kurtuluşunun anahtarını barındırma ihtimali olan evcil hayvanını geri almak isteyen Yorick ve 355, Tokyo'ya gitmek için Yakuza kalıntılarından ve küçük dişi gangsterlerdn oluşan karmaşık bir labirentten ilerlemek zorunda kalırlar. Bu sırada Drç Mann ve yeni kız arkadaşı da tatsız bir aile toplantısı için doktorun evine doğru yol almaktadırlar. Beklediklerinden çok daha düşmanca geçen bir buluşmaya rağmen sonuç olarak şaşırtıcı bir keşif yapılır: Cins kırımına neyin -ya da kimin-sebep olduğunu ortaya çıkarma yolundaki son ve ağır basan gizemin üzerindeki perde aralanır!
Bu ciltte Brian K. Vaughan ile PiaGuerra tarafından yaratılan ve çok beğenilen Vertigo serisi Y: Son Erkek'in #43-48 arasındaki sayıları bir araya getirilmiştir. Bu toplamada aynı zamanda serinin gediklileri Goran Sudzuka ve JoseMarzan, Jr'ın da çizimleri bulunmaktadır.
